Leitung und Verwaltung des Hauses erfolgen durch hauptamtliche MitarbeiterInnen, die in Kooperation mit dem ehrenamtlichen Vereinsvorstand und weiteren ehrenamtlichen MitarbeiterInnen das Jugendbegegnungshaus betreiben. Der geschäftsführende Vorstand trifft alle wichtigen organisatorischen Entscheidungen gemeinsam mit der Hausleitung.Dem sog. erweiterten Vorstand obliegen in Kooperation mit der Hausleitung die konzeptionelle und programmatische Ausrichtung des Hauses, sowie die Durchführung von Veranstaltungen. Die Betreuung der Gästegruppen erfolgt in der Regel durch ehrenamtliche MitarbeiterInnen. Das Jugendbegegnungshaus Windrad verfügt auch über einen Saal, der für Tagesveranstaltungen genutzt werden kann.
1. Vorsitzender Alfred Frank (ehrenamtlich)